Program Studi Ilmu Administrasi Negara Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik Universitas Madako Tolitoli resmi beroperasi sejak tanggal 5 Juli Tahun 2001, yang ditandai dengan terbitnya surat keputusan Menteri Pendidikan Nasional Republik Indonesia No : 76/D/O/2001 tentang Pemberian Izin Penyelenggaraan Program-Program Studi dan Pendirian Universitas Madako Tolitoli yang diselenggarakan oleh Yayasan Pendidikan Tolitoli (YPT), setelah memperhatikan Surat Pertimbangan dari Ditjen Pendidikan Tinggi No. 2069/D/T/2000 tanggal 20 Agustus 2000, dan hasil evaluasi akdemik dan administratif yang dilakukan oleh Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi.
Perkembangan program studi ilmu administrasi Negara di bawah kepemimpinan ketua prodi Daniati H. Arsyad, S.Sos., M.A.P, Nursifa, S.Sos., M.A.P, dan saat ini Muhammad Iqbal, S.Sos., M.A.P semakin berkembang, dari segi manajemen administrasi dan pengajaran, jumlah mahasiswa, fasilitas perkuliahan, dan kualitas tenaga pengajar dengan pangkat lektor dan dosen pendidikan S3, kegiatan hibah penelitian Kemendikbud RI dan publikasi jurnal terindeks sinta dan jurnal internasional bereputasi scopus.